Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Abcc8B2RUS7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Abcc8B2RUS7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms