Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms