Protein–RNA interactions for Protein: A2BIE1

Qser1, Glutamine and serine-rich 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qser1A2BIE1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Qser1A2BIE1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Qser1A2BIE1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Qser1A2BIE1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms