Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SetxA2AKX3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SetxA2AKX3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms