Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdccag3A2AIW0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdccag3A2AIW0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdccag3A2AIW0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms