Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ambra1A2AH22 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms