Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms