Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl1A2AFH1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms