Protein–RNA interactions for Protein: A0N8R1

Trav12-1, T cell receptor alpha variable 12-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-1A0N8R1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav12-1A0N8R1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav12-1A0N8R1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms