Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms