Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms