Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms