Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F7

Sncg, Gamma-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncgQ9Z0F7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncgQ9Z0F7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms