Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacsin2Q9WVE8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms