Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme4Q9WV84 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme4Q9WV84 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms