Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms