Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad18Q9QXK2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms