Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPHK2Q9NRA0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms