Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TefQ9JLC6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms