Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx5Q9JKQ4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms