Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms