Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3m1Q9JKC8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms