Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms