Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Ndst4Q9EQW8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst4Q9EQW8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Ndst4Q9EQW8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Ndst4Q9EQW8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Ndst4Q9EQW8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Ndst4Q9EQW8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Ndst4Q9EQW8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndst4Q9EQW8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndst4Q9EQW8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndst4Q9EQW8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndst4Q9EQW8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndst4Q9EQW8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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