Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms