Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3s1Q9DCR2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3s1Q9DCR2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms