Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms