Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldnd2Q9D9H2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldnd2Q9D9H2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms