Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpcat2bQ9D5U0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lpcat2bQ9D5U0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lpcat2bQ9D5U0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lpcat2bQ9D5U0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms