Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f1Q9D5Q6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms