Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rhox2aQ9D4Y3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms