Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms