Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms