Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MrnipQ9D1F5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MrnipQ9D1F5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MrnipQ9D1F5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MrnipQ9D1F5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MrnipQ9D1F5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MrnipQ9D1F5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MrnipQ9D1F5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MrnipQ9D1F5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
MrnipQ9D1F5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MrnipQ9D1F5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms