Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR3

Tomm40l, Mitochondrial import receptor subunit TOM40B, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40lQ9CZR3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40lQ9CZR3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40lQ9CZR3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms