Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc77Q9CZH8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc77Q9CZH8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc77Q9CZH8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc77Q9CZH8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc77Q9CZH8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc77Q9CZH8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc77Q9CZH8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc77Q9CZH8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc77Q9CZH8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc77Q9CZH8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc77Q9CZH8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc77Q9CZH8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc77Q9CZH8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc77Q9CZH8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc77Q9CZH8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc77Q9CZH8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms