Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms