Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms