Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI6

Cotl1, Coactosin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cotl1Q9CQI6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cotl1Q9CQI6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cotl1Q9CQI6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cotl1Q9CQI6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cotl1Q9CQI6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms