Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms