Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StambpQ9CQ26 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms