Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rrbp1Q99PL5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms