Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ1

Pcdh15, Protocadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh15Q99PJ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh15Q99PJ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh15Q99PJ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms