Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4dQ99N05 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms