Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SrrtQ99MR6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms