Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms