Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms