Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms