Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atl3Q91YH5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms