Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Odf4Q8VI88 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms